车驾进入长安后，昭宗见宫阙焚坏甚巨，只得寓居上书省。次日下诏：削夺王行瑜官爵，以李克用为邠宁四面行营都统、李思孝为北面招讨使、李思孝之弟定难节度使李思谏为东面招讨使、张璠为西面招讨使；贬右仆射崔昭纬为梧州司马，同时诏令李茂贞归镇。
自从杜让能死后，昭宗一看到崔昭纬就恨得牙根发痒，但因惧于李茂贞、王行瑜，故而始终未敢处置，此时他便迫不及待地将其驱逐出京。
崔昭纬心有不甘，一离开京师，即遣家仆携密书前往汴州，想请朱温向朝廷代为鸣冤。他万没想到，家仆却将密书直接送给了李克用。李克用看罢，又遣人将密书转送给了昭宗，并上表称崔昭纬贼心不死，必须赐死。昭宗看罢崔昭纬密书，不禁怒火中烧，当即下诏赐崔昭纬自尽。中使手持诏书追至荆南，就在驿馆中把崔昭纬斩杀了。朝野上下闻听此事，尽皆拍手称快。
李克用与李存信会兵一处，急攻梨园，王行瑜大急，连忙遣使求救于李茂贞。李茂贞虽然已向昭宗认罪，但又担心王行瑜一旦败亡，李克用必会对自己用兵！几经思量后，最后还是决定出兵相救，遣符道昭率军万人屯兵于龙泉镇，他则亲率三万大军屯兵于咸阳城外。
李克用见李茂贞仍在援助王行瑜，便再次上表，奏请昭宗下诏削夺李茂贞官爵，并请求分兵征讨。昭宗回书道：“茂贞勒兵，是备非常之事，他能主动将李继鹏斩首，已有认罪之意，既然前已赦免，不可再削职征讨，朕将严令其归镇，请爱卿与之和解，并戒令兵甲，不要犯其属地。”
李克用很是不以为然，但又不能抗旨，只好传令：全军合力剿除王行瑜，除非李茂贞主动攻击，否则不必理会凤翔军，也不得骚扰凤翔属地。
符存审率军攻夺云阳镇，云阳镇使王令诲乃王令陶之弟。王令诲扬言要报杀兄仇人，竟率军出城亲自挑战符存审。不想，只几个回合，王令诲就又被符存审生擒了。符存审一如既往，当即遣人将其送往京师，昭宗又下诏将其斩首示众了。阳守兵大惧，尽皆溃散而逃，符存审趁机攻占了云阳。如此一来，梨园就成了一座孤城了。
梨园被围日久，粮食奇缺，王行瑜无奈，只得令大将李元福率兵去邠州搬运军粮。不想，半道之上，李元福正中李存信埋伏，所率数千兵士无一生还。李元福只身逃回了梨园，王行瑜无奈，只得闭寨坚守。
河东军连连大捷，昭宗甚为高兴，竟将其爱妃魏国夫人陈阿堵及四名宫女赐给了李克用。陈阿堵不但美貌冠绝后宫，更是宫中又名的女才子，诗文歌赋无一不精。李克用本为一介武夫，哪见过如此女子，不禁大喜过望，对昭宗更是发自肺腑地感激，立令李罕之昼夜急攻梨园。
王行瑜见城中粮食已尽，河东军攻打甚急，只得弃城率军逃遁。出城不久，正中符存审、李存信两只大军的埋伏。此时的邠州军人人如惊弓之鸟，哪还有胆量厮杀，因而，河东军就如虎狼入羊群般大肆屠戮，只杀得尸横遍野，血流成河，近二万邠兵命丧荒野。李元福死命保着王行瑜突出重围，李罕之自后紧追不舍。李元福高叫道：“主公快走，我来抵挡李摩云！”说罢，回马直取李罕之，二人大战三十多个回合，李元福技逊一筹，被李罕之生擒，但王行瑜却已逃得无影无踪了。
李克用率军进入梨园后，生擒王行瑜之子王知进及王行瑜之母邱氏等二百多人，便遣人将他们连同李元福一并押往京师问斩了。
不久，探马来报，王行瑜已逃往龙泉寨，李克用当即挥军北上。在宁州的王行约、王行实见沙陀军实在势大，竟放火焚城、大肆劫掠后逃往邠州去了，宁州守将见状，只好举城投降。
符存审率先锋军抵达龙泉，只见王行瑜的龙泉寨位于一高坡之上，四面均是悬崖峭璧，看上去异常险固，守寨兵士虽只有五千人，但却都是王行瑜的亲信精锐。河东军惯于平野之战，短于攻坚拔寨，要想攻取龙泉，还真是有力无处使。符存审几经思量，最后决定在寨前三面扎营，留北面诱敌出寨。
李茂贞遣符道昭率军五千救援龙泉寨，扎营于镇西。李罕之闻讯，当即率军迎击。符道昭见河东军势大，只好下令退军，他本人单骑殿后。李罕之乘势追击，正遇符道昭，二人大战五十余合不分胜负，符道昭抽身退去，李罕之服其勇猛，又有李克用“不犯凤翔属地”之命，就不再追赶了。
次日，符存审亲率数名身手矫健之士，带着攀索、火器，趁夜登上了悬崖，摸进了龙泉寨中，四处纵火，烧毁了所有粮仓。
龙泉寨粮仓被焚，救兵又无指望，王行瑜顿感绝望了。此时，正值深冬季节，天寒地冻，而守寨兵士却还身着单衣，整日里又冷又饿，真正是度日如年。王行瑜本想能在寨中坚持几个月，以待形势变化，不想才守了一个月就实在撑不住了。他见将士们个个怨声不绝，若再强留，必生内乱，无奈之下，只得放弃了龙泉寨，率军撤回了邠州。
李克用亲率大军紧随其后，又将邠州团团围了起来。王行瑜走投无路，登城对李克用哭号道：“行瑜何罪之有？太师却如此步步相逼。”
李克用哂道：“王尚父真是健忘，举兵犯阙，劫驾乱宫，逼逐天子，这是何人所为？”
王行瑜一把鼻涕一把泪地哭道：“迫胁圣驾，都是李茂贞与李继鹏所为，太师您为何只讨邠州，而不讨凤翔呢？太师如此偏心，行瑜不服。”
李克用哈哈大笑，说道：“‘王尚父’何必过谦？既然敢做，何不敢当？李某奉天子之命征讨三个贼臣，王公你是其中之一。亏李茂贞还在冒险出兵助你，你竟然如此攀扯，羞也不羞？”
王行瑜泣道：“太师只管移兵征讨凤翔去吧，王某已走投无路，只能束身归朝了。”
李克用道：“你想束身归朝，李某无权决定，只能向朝廷奏明后，再作定夺。”
王行瑜无奈，只得与王行约、王行实率家属亲兵五百人，弃城逃遁。不想，一行人逃至庆州境内后，五百亲兵却突然发难，竟将王行瑜连同其家人全都杀了，并将他们的首级装满了一辆大车，然后赶着大车送给了李克用。
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