在此后的一段时间里，直到冷战结束之前，两国之间虽然偶尔会有一些互动，但大多数都是低水平的交流。
整体来看，这段时期，印美关系受到冷战时期“两极”格局的限制，再加上美国与巴基斯坦结盟、印度与巴基斯坦对抗以及印度与苏联准结盟等多种因素的影响，使得印美关系总体上显得冷淡、疏远，而且还经常出现龌龊和矛盾，一直未能取得实质性的突破。
接下来进入了第二个阶段，也就是冷战结束后的十年间。在这个阶段，印度和美国之间的关系逐渐发生了变化，它们开始相互借助对方的优势，实现了一种相对平稳的过渡。
在这个时期，双方都有着各自的需求和目标。对于印度来说，它希望能够在国际舞台上获得更多的认可和支持，提升自身的地位；而对于美国而言，它则需要与印度加强合作，以维护其在亚洲地区的影响力，并应对其他大国的竞争挑战。于是，在这种背景下，印美关系逐渐走向缓和与密切。
冷战结束之后，世界格局发生了巨大变化。苏联解体后，美国犹如一匹脱缰野马，迅速崛起为全球唯一的超级大国。此时，它的目光变得格外锐利，开始将战略重心转向亚洲地区，如饥似渴地寻找着每一个可能的机会，试图在中国周边建立属于自己的势力范围。而印度，则成为了美国在南亚地区极力扶持和培养的焦点。
与此同时，印度也在不断壮大，逐渐成为全球重要的政治力量之一。凭借着敏锐的洞察力和战略智慧，他们准确地抓住了有利于自身发展的机遇，毫不犹豫地向美国靠拢，以期获得更多的利益。20世纪90年代初期，拉奥总理毅然决然地启动了印度经济改革的大幕，放宽了对私人企业和外国资本的限制。这一系列大刀阔斧的改革举措犹如一阵春风，吹开了印度经济发展的蓬勃生机，带来了前所未有的高速增长。这股强大的推动力，不仅让印度经济焕发出新的活力，更进一步刺激了印美之间的经贸关系，为两国的合作注入了源源不断的动力。
在这样的背景下，印美双方的合作日益紧密，呈现出蓬勃发展的态势。双方在各个领域展开广泛而深入的合作，共同探索新的商机和发展空间。
双方在政治、军事、经济等诸多领域与美方展开合作，双边贸易也呈不断增长之势，仅1995年年初两国就签订了高达14亿美元的投资协议和12项商业协议，美方在当年一跃成为印度最大的贸易伙伴和最大的投资国。两国还频繁举行有关安全和战略合作的高层会议，为之后美印关系的持续升级奠定了基石。从1990年到2000年，印美贸易总额如滚雪球般从52亿美元扩大到580亿美元，美国对印投资也从亿美元飙升到24亿美元。
这一时期，印巴冲突和印度公开核试验成为了当时影响美印关系的关键因素。
至于印度和巴基斯坦的冲突，巴基斯坦政局动荡、执意发展核武、经济发展停滞不前、军人专政，一些高层甚至与恐怖主义纠缠不清，已然成为了一个令人头疼的盟友。他们在对抗苏联前线的地缘价值已化为泡影。因此，在调解印巴冲突时，美国的立场愈发偏向印度。克林顿政府虽然谴责印度在克什米尔地区采取的“军事暴力”行动，但是也只是在口头和外交层面上指出印度的行为违反了人权，并没有采取进一步的行动。特别是在1999年印巴卡吉尔冲突期间，美国一反常态，没有站在巴基斯坦一边，而是致力于通过外交途径协调解决，与印度的立场逐渐趋同。
关于印度核试验，1998年印度核试验后，美国虽然按照惯例对印度实施了制裁，但也只是停止了对印度的非人道主义援助和部分武器技术交易等，所有的制裁基本上都是“象征性”的制裁。印度投桃报李，支持布什总统的导弹防御计划和在阿富汗的反恐战争。尤其是前者，让当时遭到许多国家反对的布什总统感到非常高兴，放松了因核武器而开始的制裁，重新向印度出口武器。
总的来说，在这一时期，两国各取所需，在试探中逐渐靠拢，印美关系总体上平稳起步。然而，在表面的热烈之下，两国的核心利益始终存在差异，合作时也难免会留有一手。例如，印度想要成为名副其实的核大国，这与美国限制核扩散的思路相矛盾；印美在巴基斯坦问题上的意见也存在很大分歧。更重要的是，过去的历史表明，印度作为一个有脾气的大国，并不一定会完全听从美国的意见。这些都将成为印度与美国关系进一步发展的阻碍。
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